Nghiên cứu này cung cấp dữ liệu thực tế về tình trạng kháng kháng sinh của các chủng vi khuẩn phân lập từ cá chép tại tỉnh Cần Thơ, An Giang, Việt Nam. Tổng cộng 200 mẫu (vẩy, da, mô cơ và các cơ quan nội tạng) từ cá chép được thu thập từ các ao hồ tự nhiên và một số cơ sở nuôi trồng thủy sản tại Cần Thơ, An Giang. Các mẫu được tiến hành làm sạch, khử trùng sau đó tiến hành đồng nhất và nuôi cấy phân lập trên các môi trường khác nhau. Các chủng vi khuẩn được định danh bằng hệ thống MALDI-TOF MS và đánh giá độ nhạy cảm với kháng sinh bằng phương pháp khuếch tán đĩa Kirby-Bauer. Kết quả chúng tôi đã phân lập được 607 chủng vi khuẩn đồng thời ghi nhận kiểu hình kháng kháng sinh ở nhiều nhóm vi khuẩn. Cụ thể, các chủng thuộc chi Enterobacter và Serratia có tỉ lệ kháng lên tới 90,6–100% với amoxicillin/acid clavulanic. Trong khi đó, Hafnia alvei thể hiện tỷ lệ kháng cao với cephalosporin thế hệ 3 (81,3%) và kháng trung bình với cephalosporin thế hệ 4 (25%). Ở vi khuẩn Pseudomonas spp. cho thấy sự đa kháng, các chủng vi khuẩn này thể hiện tính kháng 100% với ciprofloxacin, cephalosporin (thế hệ 3 và 4) và imipenem. Tương tự, toàn bộ chủng Acinetobacter được phân lập đều kháng ciprofloxacin (100%). Đối với chi Aeromonas, tỷ lệ kháng levofloxacin là 61,8%; đồng thời 34,7% chủng kháng với ít nhất một kháng sinh khác trong nhóm fluoroquinolone. Những phát hiện này phản ánh thực trạng kháng kháng sinh đang tồn tại ở các vi khuẩn phân lập từ động vật thủy sản cho thấy sự cần thiết của việc tiếp tục theo dõi và đánh giá tình trạng kháng kháng sinh trong lĩnh vực thủy sản.

This study provided empirical data on the antibiotic resistance profiles of bacteria isolated from fish of the family Cyprinidae in Can Tho and An Giang provinces, Vietnam. A total of 200 samples including scales, skin, muscle tissue, and internal organs were collected from Cyprinidae obtained from natural ponds, lakes, and aquaculture facilities. The samples were cleaned, surface-sterilized, homogenized, and cultured for bacterial isolation on different media. Bacterial isolates were identified using the MALDI-TOF MS system, and antibiotic susceptibility was evaluated using the Kirby-Bauer disk diffusion method. The results showed that 607 bacterial strains were isolated, and alarming antibiotic resistance phenotypes were recorded in multiple bacterial groups. Specifically, isolates from the genera Enterobacter and Serratia exhibited extremely high resistance rates (90.6–100%) to amoxicillin/clavulanic acid. Meanwhile, Hafnia alvei showed high resistance to third-generation cephalosporins (81.3%) and moderate resistance to fourth-generation cephalosporins (25%). Pseudomonas spp. demonstrated multidrug resistance, with all isolates exhibiting 100% resistance to ciprofloxacin, third- and fourth-generation cephalosporins, and imipenem. Similarly, all recovered Acinetobacter isolates were resistant to ciprofloxacin (100%). Among Aeromonas isolates, the resistance rate to levofloxacin reached 61.8%, and 34.7% were resistant to at least one additional fluoroquinolone. These findings reflect the existing status of antibiotic resistance among bacterial isolates from aquatic animals and highlight the need for continued surveillance and assessment of antibiotic resistance in aquaculture.